계명대학교 동산의료원은 1899년 미국 예수교 북장로파 대한선교 유지재단에서 파견된 존슨 (Woodbridge O. Johnson) 의료선교사가 제중원을 개설하여 의료활동을 시작한 것이 모태가 되었다. 제중원은 영남지역에서 가장 먼저 서양의술을 도입하여 의료가 낙후되었던 영남 지역에 새로운 서양의료를 시술하여 수 많은 사람을 질병의 고통으로부터 해방시키고 복음을전하면서 활발하게 의료선교 활동을 전개하였다.

제중원은 1905년 대구동산기독병원으로 종합병원의 체제를 마련하여 발전하였으며, 이 후 플렛쳐 원장(Archibald G. Fectcher)과 마펫 원장(Howard Moffet)이 일제의 압박과 6.25 동란 후 어려웠던 시절에 선진 의료기술을 전수하여 병원이 발전하는데 크게 기여하였다. 계명대학교와 통합후 의과대학, 간호대학, 대구동산병원, 경주동산병원을 통합하는 동산의료원으로 체제가 정비되었다.

의과대학은 첨단 의학교육과 연구 시설을 마련하여 세계 속의 대학으로 발전하기 위하여 2000년 5월 20일 새 교사를 기공하여 공사가 진행중에 있다.

	1899. 10. 1	미국 예수교 북장로파 대한선교회 유지재단에서 단과병원(제중원) 설립
	1905.	종합병원으로 발족
	1979. 1. 22	계명대학교 이공대학에 의예과 설치 인가
	1979. 10. 16	초대 학장으로 정재홍 교수 취임

	1980. 10. 2	의과대학 설치인가
	1981. 2. 6	의과대학 교사 착공
	1981. 3. 1	2대 학장에 전도기 교수 취임
	1981. 3. 2	제1회 의학과 진입식(59명)
	1982. 6. 15	의과학연구소 개소
	1982. 7. 1	의과대학 교사 준공
	1982. 9. 1	3대 학장에 정재홍 교수 취임
	1982. 9. 11	계명대학교 동산의료원 발족
	1984. 9. 1	4대 학장에 채의업 교수 취임
	1984. 10. 5	자연과학대학 의예과로 소속 변경
	1984. 11. 27	대학원 의학과 설립인가
	1985. 2. 22	제1회 학위수여식
	1986. 9. 1	5대 학장에 송준영 교수 취임
	1989. 3. 1	가정의학교실
	1989. 3. 21	6대 학장에 강진성 교수 취임

	1990. 3. 1	의과대학 간호학과 신설, 재활의학교실
	1990. 5. 22	7대 학장에 김인홍 교수 취임
	1991. 3. 11	계명대학교 의과대학 부속 경주동산병원 개원
	1991. 11. 18	일본 나가사키의과대학과 교류협정 체결
	1992. 5. 22	8대 학장에 강창수 교수 취임
	1993. 3. 1	면역학교실 신설
	1994. 3. 1	간호학과 간호대학 승격
	1994. 5. 22	9대 학장에 강진성 교수 취임
	1995. 12. 1	핵의학, 응급의학, 의공학교실 신설
	1996. 3. 1	의학유전연구소 개소
	1996. 5. 24	10대 학장에 전재규 교수 취임
	1998. 3. 1	의과대학 의예과로 소속 변경
	1998. 5. 24	11대 학장에 박영남 교수 취임
	1999. 3. 1	한의학교실 신설
	1999. 6. 30	뇌연구소 개소
	1999. 12. 1	법의학교실 신설 , 의학교육학교실 신설

	2000. 4. 14	심혈관연구소 및 신장연구소 개소
	2000. 5. 20	의과대학, 의과학 연구동 신축 기공
	2000. 5. 24	12대 학장에 박영남 교수 취임
	2001. 3. 1	13대 학장에 서수지 교수 취임
	2001. 3. 1	의학유전공학교실 신설
	2002. 3. 1	보건의료정보기술연구소 개소
	2002. 7. 1	의료정보학교실 신설
	2002. 9. 1	만성질환예방 및 치료화학제연구 CDR센터 설립
	2003. 3. 1	14대 학장에 박우현 교수 취임
	2004. 11. 1	생체정보기술개발사업단 설립(산업자원부지원)
	2004. 11. 3~4	한국의학교육평가원 의과대학 인정평가실시
	2005. 2. 25	한국의학교육평가원 의과대학 인정평가 "완전인정"
	2005. 3. 1	15대 학장에 임만빈 교수 취임
	2005. 9. 27	계명의대 카플란센타 개소
	2007. 2. 22	제23회 학위수여식 - 현재까지 의학사 1,819명 배출
	2007. 3. 1	제16대 학장에 김현철 교수 취임